Powstał początkiem XVIII wieku; służył Żydom ustrzyckim i tym z okolicznych wsi. Do drugiej wojny światowej u wejścia na kirkut stał drewniany dom przedpogrzebowy. Został zniszczony przez Niemców podczas okupacji. W tym samym czasie hitlerowcy żydowskimi rękami wynieśli z cmentarza co najmniej sto macew; wybrukowali nimi ustrzyckie place i ulice, a także umocnili brzegi Strwiąża. Kirkut był miejscem kaźni setek Żydów, spędzanych tu z miasteczka oraz przywożonych z pobliskich wiosek. W latach dziewięćdziesiątych część odkrytych w mieście płyt nagrobnych ponownie przewieziono na cmentarz. Obecnie znajduje się tu około czterystu macew, część z nich jest powalona lub przysypana ziemią. Ustrzycka żydowska nekropolia jest trzecią pod względem wielkości w Bieszczadach – po Lesku i Lutowiskach. Prowadzi do niej czarny szlak spacerowy. Kirkut na szlaku chasydzkim, w 2018 roku został gruntownie odczyszczony, m.in. z wydatną pomocą więźniów z Zakładu Karnego w Uhercach Mineralnych. U wejścia na kirkut tablica informacyjna w czterech językach: hebrajskim, polskim, angielskim i niemieckim. Znajduje się na Szlaku Umocnień Obronnych i Pomników Przeszłości oraz Szlaku Budowli i Pomników Sakralnych.
Cmentarz żydowski jest pod opieką Bieszczadzkiego Centrum Turystyki i Promocji w Ustrzykach Dolnych.
